南京博物院：位于南京市玄武區(qū)中山東路321號(hào)，是中國三大博物館之一，也是中國第一座由國家投資興建的大型綜合類博物館。南京博物院占地13萬余平方米，為“一院六館”格局，即歷史館、特展館、數(shù)字館、藝術(shù)館、非遺館、民國館。
侵華日軍南京大屠殺遇難同胞紀(jì)念館：位于南京市建鄴區(qū)水西門大街418號(hào)，通稱江東門紀(jì)念館，選址于南京大屠殺江東門集體屠殺遺址及遇難者叢葬地，是中國首批國家一級(jí)博物館，首批全國愛國主義教育示范基地，全國重點(diǎn)文物保護(hù)單位，首批國家級(jí)抗戰(zhàn)紀(jì)念設(shè)施、遺址名錄，也是國際公認(rèn)的二戰(zhàn)期間三大慘案紀(jì)念館之一。
六朝博物館：位于江蘇省南京市玄武區(qū)長江路302號(hào)總統(tǒng)府東側(cè)，是一座展示六朝文化及文物遺存的專題性博物館。
南京云錦博物館：位于江蘇省南京市建鄴區(qū)茶亭東街240號(hào)，主要展示以南京云錦為代表的我國民族織錦藝術(shù)。
明孝陵博物館：位于江蘇省南京市玄武區(qū)四方城1號(hào)3號(hào)樓，是關(guān)于明太祖朱元璋、世界文化遺產(chǎn)明孝陵和南京明文化的專題展館。
江寧織造博物館：位于江蘇省南京市玄武區(qū)長江路123號(hào)，建筑整體風(fēng)格是取中國山水畫中深遠(yuǎn)、高遠(yuǎn)、平遠(yuǎn)之意境。
江南文化絲綢博物館
金陵竹刻藝術(shù)博物館
南京直立人化石遺址博物館
南京古生物博物館
中華指紋博物館
南京市越劇博物館
周園（佛教文化、徽派建筑主題）
老城南記憶館等。
這些展覽館涵蓋了不同領(lǐng)域和主題，如絲綢、竹刻、化石、古生物、指紋、越劇等。每個(gè)展覽館都有其獨(dú)特的特色和亮點(diǎn)，可以滿足不同人群的參觀需求。
